161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0278 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
229 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
229 aa  159  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 
229 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
238 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  36.12 
 
 
233 aa  151  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.09 
 
 
231 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
245 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  36.91 
 
 
245 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
233 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
234 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
248 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  34.3 
 
 
251 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  33.47 
 
 
231 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  34.76 
 
 
254 aa  126  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 
257 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  34.32 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  29.32 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
254 aa  119  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 
234 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  33.2 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  32.24 
 
 
271 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  30.8 
 
 
258 aa  112  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  34.82 
 
 
232 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.14 
 
 
225 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 
254 aa  105  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  37.09 
 
 
229 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
228 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 
230 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 
252 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  34.22 
 
 
252 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
219 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 
233 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  29.39 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
251 aa  91.7  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
230 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
236 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  30 
 
 
252 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
236 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
242 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  31.42 
 
 
242 aa  87  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  31.56 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  32.07 
 
 
275 aa  85.5  8e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  29.26 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  35.26 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
249 aa  82  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  28.19 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
662 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  30.24 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  27.15 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  27.35 
 
 
219 aa  79  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 
269 aa  77  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  28.65 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.74 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  28.43 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  28.1 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  29.72 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  26.64 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  22.81 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  27.18 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
263 aa  62.4  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  26.46 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  29.73 
 
 
137 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>