260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1240 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  100 
 
 
233 aa  483  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  62.45 
 
 
234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  55.75 
 
 
237 aa  268  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 
234 aa  258  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  54.71 
 
 
229 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  53.48 
 
 
236 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 
231 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  45.12 
 
 
229 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  44.5 
 
 
229 aa  194  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  45.62 
 
 
229 aa  192  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  42.59 
 
 
245 aa  186  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  41.47 
 
 
229 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.27 
 
 
231 aa  178  8e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
238 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
245 aa  162  6e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
242 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  38.63 
 
 
251 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  39.55 
 
 
228 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
225 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 
254 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  40.53 
 
 
251 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
240 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
257 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 
233 aa  151  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  40 
 
 
236 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  39.22 
 
 
219 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
252 aa  143  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
252 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
233 aa  141  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  36.1 
 
 
219 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  37.16 
 
 
233 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  37.98 
 
 
236 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
240 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
248 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
257 aa  135  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  37.32 
 
 
228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  37.83 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  36.68 
 
 
255 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
251 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  34.63 
 
 
225 aa  131  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  37.44 
 
 
244 aa  131  9e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  35.32 
 
 
248 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 
239 aa  128  9.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 
230 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
258 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 
271 aa  124  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
243 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
303 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  33.94 
 
 
252 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.19 
 
 
232 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  31.38 
 
 
257 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
242 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
249 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 
237 aa  118  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  35.23 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  35.64 
 
 
244 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  33.96 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 
222 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  31.05 
 
 
244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
269 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  34.5 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  32.55 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
286 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
260 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  39.15 
 
 
275 aa  109  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
320 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 
202 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
254 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
223 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
232 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
232 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  32.06 
 
 
240 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
662 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
243 aa  106  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
248 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
237 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
263 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
252 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
234 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
234 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>