More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03600 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  48.87 
 
 		 229 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 229 aa  130  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 		 229 aa  126  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 240 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 228 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 231 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 		 239 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 252 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 248 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 252 aa  110  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 269 aa  110  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 186 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 251 aa  106  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 219 aa  103  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 286 aa  104  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  45.24 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.23 
 
 		 232 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  40.16 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 234 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 246 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 229 aa  99  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  39.57 
 
 		 237 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 303 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  45.87 
 
 		 144 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  35.95 
 
 		 273 aa  96.7  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  37.88 
 
 		 233 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  43.12 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 662 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  44.17 
 
 		 267 aa  95.9  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 148 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 248 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 284 aa  94.7  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 230 aa  94.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 242 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 249 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 229 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 320 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  39.37 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  45.16 
 
 		 156 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 165 aa  92.8  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 231 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 229 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  44.04 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.03 
 
 		 345 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  44.14 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 236 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  41.61 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 143 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  45.37 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 237 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 260 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 		 226 aa  90.1  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 236 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  42.98 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.73 
 
 		 346 aa  88.6  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.02 
 
 		 345 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  42.11 
 
 		 244 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  40.15 
 
 		 252 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 130 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 251 aa  87.8  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  34.33 
 
 		 237 aa  87.8  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.03 
 
 		 346 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 238 aa  87.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  38.35 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 252 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 244 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 236 aa  85.5  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 234 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3479  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.32 
 
 		 346 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0251812  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4887  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.32 
 
 		 346 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.150222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5399  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.32 
 
 		 346 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 251 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 244 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>