177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3393 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  50.59 
 
 
251 aa  248  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 
257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  42.63 
 
 
254 aa  208  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  42.56 
 
 
257 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 
254 aa  205  7e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 
254 aa  189  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  42.08 
 
 
258 aa  184  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  40 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4400  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
257 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
244 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
251 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
238 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
242 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  37.55 
 
 
229 aa  164  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  37.39 
 
 
245 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.72 
 
 
229 aa  161  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  37.55 
 
 
245 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  37.66 
 
 
231 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
225 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
229 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
229 aa  153  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  35.22 
 
 
231 aa  152  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
237 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 
233 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
252 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  33.19 
 
 
230 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
252 aa  141  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  37.05 
 
 
233 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  37.95 
 
 
229 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
240 aa  136  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0278  NUDIX hydrolase  35.62 
 
 
240 aa  133  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000200182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
267 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
234 aa  129  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 
251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.75 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
236 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
244 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
219 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
234 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  34.47 
 
 
236 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
228 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  28.84 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 
251 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  26.67 
 
 
303 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
222 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  31.8 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
248 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
251 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  28.64 
 
 
232 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 
249 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
202 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
237 aa  99.4  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
230 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  30.69 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  28.05 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  28.11 
 
 
286 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  27.13 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  28.77 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  26.09 
 
 
244 aa  92  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.89 
 
 
275 aa  92  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  28.09 
 
 
259 aa  92  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  27.85 
 
 
255 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  28.04 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  27.96 
 
 
221 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  31.87 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
223 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  27.98 
 
 
231 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  27.39 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  27.1 
 
 
219 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  28.3 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  27.6 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  28.05 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  27.1 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  27.07 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
226 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  26.03 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  26.2 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  27.14 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  22.41 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  26.27 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  23.94 
 
 
234 aa  72  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  26.46 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>