135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3845 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  100 
 
 
224 aa  441  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  52.86 
 
 
229 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  49.52 
 
 
217 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  49.52 
 
 
217 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  50.71 
 
 
217 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  49.52 
 
 
216 aa  155  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
221 aa  155  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
238 aa  135  7.000000000000001e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  36.87 
 
 
242 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 
252 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 
242 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  32.38 
 
 
252 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  39.78 
 
 
222 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1357  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.266924  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
237 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  34.73 
 
 
255 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.73 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  33.47 
 
 
259 aa  92  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  36.32 
 
 
221 aa  91.7  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 
244 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  34.33 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 
249 aa  89  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
219 aa  89  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
286 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
244 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  35.27 
 
 
243 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
229 aa  85.1  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 
236 aa  85.1  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  33.99 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  38.07 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  36.94 
 
 
244 aa  82  0.000000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  32.27 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
233 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 
248 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  30.45 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  29.26 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
260 aa  74.7  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
248 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  28.5 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  32.44 
 
 
662 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  27.57 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
231 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2633  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29366  normal  0.215987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  33.17 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  24.14 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  23.37 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  24 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  27.75 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
255 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  36.73 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  27.4 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  23.47 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0652  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  33.33 
 
 
231 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  32.68 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  34.43 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  26.73 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  25.13 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  29.9 
 
 
263 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  26.17 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  33.52 
 
 
275 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  29.89 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  27.81 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  27.6 
 
 
251 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  28.02 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  23.98 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  27 
 
 
244 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  28.51 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0149  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>