206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3086 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  100 
 
 
232 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  100 
 
 
232 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  99.55 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  83.33 
 
 
234 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  81.2 
 
 
234 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  79.06 
 
 
236 aa  370  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  65.07 
 
 
240 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  64.68 
 
 
234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  61.16 
 
 
229 aa  271  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  58.52 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  58.74 
 
 
253 aa  250  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  57.46 
 
 
243 aa  249  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  57.08 
 
 
243 aa  248  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  41.36 
 
 
219 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  39.49 
 
 
248 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  41.08 
 
 
251 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  40.1 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.02 
 
 
229 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  40.51 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
269 aa  113  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 
223 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 
226 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  35.68 
 
 
219 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.44 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
231 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  34.7 
 
 
236 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
251 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 
233 aa  108  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
230 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
229 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 
662 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  33 
 
 
244 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
233 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  29 
 
 
231 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  37.76 
 
 
244 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
233 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
233 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  32.66 
 
 
225 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
242 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
234 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
202 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  34.36 
 
 
246 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  34.91 
 
 
228 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  31.08 
 
 
237 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
248 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 
286 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
251 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 
249 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  28.96 
 
 
236 aa  99  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
238 aa  99  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  35.41 
 
 
237 aa  98.2  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
234 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  32.2 
 
 
275 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  29.58 
 
 
245 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
248 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  34.93 
 
 
244 aa  93.6  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  28.98 
 
 
320 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 
229 aa  91.7  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  25.78 
 
 
284 aa  88.2  9e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
273 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  26.44 
 
 
245 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  26.39 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  33.51 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  31.82 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  32.81 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.6 
 
 
137 aa  81.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  31.44 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0588  NUDIX hydrolase  25.89 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00602457 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  32.29 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  25.94 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  27.59 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>