148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3795 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 228 aa  438  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0149  NUDIX hydrolase  52.68 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 219 aa  82  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  31.56 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  31.98 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  37.97 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  37.97 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 		 221 aa  72  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  32.49 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  34.76 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  31.92 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  25.71 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  33.95 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  28.64 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  35.09 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  28.49 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 662 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  33.48 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  24.75 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  26.04 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.39 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  31.78 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 229 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 234 aa  62  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  29.45 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  31.46 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  26.2 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  31.79 
 
 		 229 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  32.42 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  28.42 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  30.97 
 
 		 144 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  31.15 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  31.52 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  29.05 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  25 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  28.14 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  21.5 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 139 aa  52  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  23.7 
 
 		 245 aa  52.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  24.38 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 248 aa  52  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 186 aa  52  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  27.01 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0357  NUDIX hydrolase  23.87 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 320 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 249 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>