138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2247 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  60 
 
 
231 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  59.57 
 
 
231 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  61.3 
 
 
229 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
237 aa  120  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  37.23 
 
 
237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 
242 aa  109  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  40 
 
 
252 aa  108  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 
244 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
244 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
233 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
233 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000698  nudix-related transcriptional regulator NrtR  31.74 
 
 
241 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0480026  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  30.09 
 
 
241 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  35.15 
 
 
251 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
244 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  38.92 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
251 aa  95.5  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0042  hypothetical protein  26.55 
 
 
238 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  32.75 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
228 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
255 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  34.03 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  31.63 
 
 
232 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  31.31 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  30.54 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  24.9 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  27.44 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  29.51 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
231 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  29.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  32 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  33.95 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  27.39 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  31.84 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  32.27 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  32.47 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
273 aa  72  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  26.76 
 
 
225 aa  71.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  30 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  30.73 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  31.02 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  31.46 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  30.96 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  26.48 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  31.8 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  25.47 
 
 
234 aa  65.5  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  28.83 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  26.39 
 
 
245 aa  62.4  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  28.5 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  28.7 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 
217 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
253 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  28 
 
 
242 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
223 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>