124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0149 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0149  NUDIX hydrolase  100 
 
 
205 aa  402  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3795  NUDIX hydrolase  52.68 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
228 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  33.65 
 
 
232 aa  74.7  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
230 aa  73.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  31.22 
 
 
252 aa  72  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.63 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  30.96 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  30.24 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  27.49 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  23.92 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  32.99 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  29.11 
 
 
239 aa  61.6  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
248 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0832  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  28.72 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0850  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.985377  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 
236 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5180  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
216 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  30.59 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  29.58 
 
 
240 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  31.91 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  29.36 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2247  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267039  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
234 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  26.37 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  30.17 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  33.5 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  31.61 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
251 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  36 
 
 
143 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3845  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
224 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00494559  normal  0.589145 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
135 aa  55.5  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  32.13 
 
 
231 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  28 
 
 
286 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
249 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
269 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30 
 
 
236 aa  53.9  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0850  NUDIX hydrolase  32.02 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.491635  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  29.38 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  30.05 
 
 
237 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  20.85 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 
154 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
221 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
143 aa  53.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  25.51 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
148 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  30.99 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  24.36 
 
 
267 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3688  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
221 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.649761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
144 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  29.22 
 
 
662 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  34.35 
 
 
146 aa  51.6  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
165 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2968  NUDIX hydrolase  30.29 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  27.51 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
153 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
234 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  23.81 
 
 
258 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
150 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64930  hypothetical protein  29.58 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  29.76 
 
 
244 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  29.47 
 
 
222 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
140 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  31.35 
 
 
243 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 
139 aa  48.5  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  24.27 
 
 
245 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
150 aa  48.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5642  hypothetical protein  29.11 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
140 aa  48.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>