More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0519 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  100 
 
 
146 aa  286  6e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  65.75 
 
 
149 aa  192  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  63.38 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  60.99 
 
 
151 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
144 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
148 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
148 aa  153  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
156 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  56.39 
 
 
143 aa  149  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 
140 aa  147  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 
140 aa  146  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  59.23 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  55.97 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  60.77 
 
 
157 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
130 aa  140  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
150 aa  140  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  54.74 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  56.03 
 
 
154 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  52.59 
 
 
142 aa  134  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  47.73 
 
 
144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  52.31 
 
 
212 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 
166 aa  124  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  50.76 
 
 
139 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  51.59 
 
 
150 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  51.2 
 
 
171 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  49.22 
 
 
135 aa  120  7e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  48.06 
 
 
171 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  50.78 
 
 
156 aa  114  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  46 
 
 
176 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
236 aa  104  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  43.66 
 
 
237 aa  99.4  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  38.35 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  43.97 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.12 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.08 
 
 
237 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
229 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  41.32 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 
269 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
219 aa  71.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
273 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  44.94 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  45 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
239 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  33.08 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
248 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
286 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.53 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
230 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
242 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
160 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
246 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  48.05 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.53 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  29.75 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  49.18 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 
231 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 
229 aa  61.2  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.21 
 
 
232 aa  61.2  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  40 
 
 
158 aa  61.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
267 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.68 
 
 
152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
184 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  38.79 
 
 
320 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  39.47 
 
 
158 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.75 
 
 
154 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  28 
 
 
159 aa  60.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>