More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0883 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  100 
 
 
151 aa  302  8.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  60.74 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  60.99 
 
 
146 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  66.91 
 
 
156 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  59.09 
 
 
150 aa  147  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  60.8 
 
 
150 aa  145  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  60.31 
 
 
150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 
140 aa  139  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 
144 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  58.02 
 
 
153 aa  138  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  57.89 
 
 
154 aa  137  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  55.8 
 
 
140 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  56.49 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  55.15 
 
 
140 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 
150 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  51.75 
 
 
143 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
148 aa  133  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  57.94 
 
 
150 aa  133  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  59.2 
 
 
157 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
137 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 
154 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  47.48 
 
 
143 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  50 
 
 
144 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  52.71 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
135 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  47.01 
 
 
137 aa  111  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
171 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 
171 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 
171 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  48.85 
 
 
132 aa  103  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  44.29 
 
 
156 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 
212 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  43.26 
 
 
237 aa  96.7  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 
176 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
236 aa  86.3  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  39.37 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  43.8 
 
 
229 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  39.84 
 
 
232 aa  78.2  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
237 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
164 aa  73.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40 
 
 
229 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.53 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
229 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
240 aa  71.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  48.31 
 
 
224 aa  70.9  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
228 aa  70.1  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
151 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  38.19 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
267 aa  63.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
355 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  42.18 
 
 
249 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
242 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
303 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  44.21 
 
 
362 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 
320 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 
225 aa  61.6  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 
349 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 
158 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
231 aa  60.1  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
239 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 
273 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
284 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
246 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  34.21 
 
 
250 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50.91 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
248 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
244 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
230 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.14 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
243 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  28.26 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 
662 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
167 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0519  NUDIX family hydrolase  38.57 
 
 
168 aa  57.4  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.259714  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  38.58 
 
 
165 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  39.77 
 
 
190 aa  57  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  27.54 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  51.85 
 
 
155 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1101  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>