More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1530 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  51.88 
 
 
144 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  51.54 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
151 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 
154 aa  129  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  54.46 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
150 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  53.57 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  54.46 
 
 
140 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  50.38 
 
 
150 aa  124  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  50.77 
 
 
142 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
154 aa  121  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
143 aa  120  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
150 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  48.46 
 
 
150 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
135 aa  118  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  50.43 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 
137 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  45.52 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  47.9 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  52.78 
 
 
157 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
236 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  50 
 
 
171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
166 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  50 
 
 
156 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  45.8 
 
 
139 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 
171 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.3 
 
 
156 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41.48 
 
 
132 aa  94  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.26 
 
 
237 aa  92.8  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  36.17 
 
 
137 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
229 aa  80.1  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  36.15 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
240 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
237 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  37.72 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  32.81 
 
 
228 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  28.37 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  29.08 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
233 aa  63.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
286 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 
165 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  28.37 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
269 aa  63.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 
251 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.37 
 
 
152 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  28.37 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  27.66 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  27.66 
 
 
154 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  27.66 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  45.56 
 
 
224 aa  60.8  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 
252 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
226 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36 
 
 
362 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 
303 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 
146 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
249 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
229 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  29.55 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.51 
 
 
159 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
184 aa  57  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>