More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2116 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  100 
 
 
136 aa  264  4e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  72.06 
 
 
136 aa  200  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  72.18 
 
 
139 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  72.09 
 
 
137 aa  167  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 
154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  44.54 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 
147 aa  82.8  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  50.57 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  43.52 
 
 
473 aa  77  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  35.66 
 
 
147 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  38.28 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  40 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  39.37 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  39.37 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  39.37 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 
167 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  39.39 
 
 
139 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
161 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.6 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  39.08 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  37.63 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  45.88 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 
137 aa  67  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
171 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  55.36 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  40 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  44.21 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  51.67 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  49.49 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  61.67 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  34.78 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 
184 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5104  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.13 
 
 
345 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180722  normal  0.842074 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
171 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  38.79 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  38.79 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  38.79 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 
167 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 
140 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  36 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4267  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  53.7 
 
 
346 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178343  normal  0.0602888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  38.32 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1179  NUDIX hydrolase  54.24 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  54.39 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  36.45 
 
 
172 aa  61.2  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  48.28 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  60.78 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  52.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  52.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  52.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  52.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  52.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  51.85 
 
 
346 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5069  mutT/nudix family protein  52.63 
 
 
168 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>