More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2287 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  61.54 
 
 
212 aa  193  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  65.54 
 
 
153 aa  188  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  60.53 
 
 
166 aa  186  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 
154 aa  183  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  57.76 
 
 
176 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  56.12 
 
 
150 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 
150 aa  144  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 
154 aa  143  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  54.2 
 
 
144 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  52.55 
 
 
148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 
157 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  53.28 
 
 
148 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 
140 aa  137  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  55.32 
 
 
142 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 
140 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  51.94 
 
 
149 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
143 aa  133  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  60.5 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  51.54 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 
236 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  54.69 
 
 
146 aa  125  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 
137 aa  125  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  50.37 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  53.54 
 
 
144 aa  117  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  48.06 
 
 
171 aa  114  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
137 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  46.51 
 
 
171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  48.51 
 
 
150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  57.66 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  45.16 
 
 
137 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  45 
 
 
151 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 
156 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 
240 aa  92  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 
252 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  39.26 
 
 
148 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 
231 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
229 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
178 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
229 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 
151 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
252 aa  84  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
228 aa  84.3  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
184 aa  84.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
151 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
151 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  41.5 
 
 
273 aa  84  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.04 
 
 
237 aa  80.9  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  52.75 
 
 
224 aa  80.5  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  42.55 
 
 
248 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 
190 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  54.41 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  50.62 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  34.17 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 
155 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  37.38 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  33.8 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  32 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.33 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  36.89 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 
265 aa  70.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  31.2 
 
 
154 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 
163 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  29.56 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  30.65 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  38.81 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  40.48 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  34.56 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 
140 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>