More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4483 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  100 
 
 
153 aa  302  8.000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  46.62 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
153 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.85 
 
 
167 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  45.05 
 
 
155 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
154 aa  89  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 
161 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
167 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
141 aa  85.1  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.37 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  39.83 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
178 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  40.38 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.3 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  39.67 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  39.67 
 
 
158 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
166 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 
147 aa  71.2  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
196 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  33.07 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 
201 aa  70.1  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  42.73 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  36.36 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.71 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  38.74 
 
 
473 aa  67  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.81 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  35.54 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  45 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  48.75 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  35.54 
 
 
195 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  43.52 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  40.78 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  40.78 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 
195 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  40.78 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  40.91 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
212 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  36.51 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  36.75 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
194 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>