More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2643 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  100 
 
 
149 aa  301  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  65.75 
 
 
146 aa  192  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  59.23 
 
 
148 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  59.86 
 
 
150 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  55.73 
 
 
144 aa  157  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  57.69 
 
 
148 aa  157  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  59.4 
 
 
143 aa  155  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 
150 aa  155  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 
150 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  61.36 
 
 
150 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  63.12 
 
 
156 aa  153  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  65.15 
 
 
157 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  61.9 
 
 
150 aa  150  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  56.62 
 
 
142 aa  148  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  61.94 
 
 
150 aa  146  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  53.38 
 
 
143 aa  143  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  55.81 
 
 
154 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 
140 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  53.62 
 
 
140 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  57.58 
 
 
139 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  56.35 
 
 
154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  55.38 
 
 
144 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  53.12 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 
137 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  54.2 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  48.06 
 
 
171 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 
135 aa  123  9e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.94 
 
 
156 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
171 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
137 aa  121  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  47.29 
 
 
171 aa  120  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 
132 aa  115  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 
236 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  46.71 
 
 
176 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  41.26 
 
 
237 aa  96.7  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  44.44 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  43.15 
 
 
231 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
240 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
229 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  42.64 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  41.55 
 
 
157 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
179 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 
229 aa  74.3  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
233 aa  74.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  43.61 
 
 
237 aa  73.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  40.87 
 
 
151 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 
273 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
228 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  47.19 
 
 
224 aa  71.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  41.67 
 
 
362 aa  70.5  0.000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  39.52 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.17 
 
 
355 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  35 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 
242 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  38.4 
 
 
320 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 
303 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
239 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 
349 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  28.36 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 
284 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.17 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
260 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.1 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  28.36 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  50.94 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
229 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 
234 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
226 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.33 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.17 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
155 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  27.82 
 
 
152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  27.07 
 
 
154 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
225 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  40.29 
 
 
246 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 
184 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  53.7 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>