More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0812 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  100 
 
 
166 aa  341  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  58.5 
 
 
153 aa  171  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  60.53 
 
 
156 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  57.45 
 
 
154 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  54.23 
 
 
212 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 
157 aa  157  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  53.33 
 
 
154 aa  157  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  58.39 
 
 
150 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  55.4 
 
 
150 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  52.52 
 
 
150 aa  155  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  52.52 
 
 
150 aa  153  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  55.64 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
144 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  54.78 
 
 
176 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  54.01 
 
 
148 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  55.71 
 
 
150 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  55.56 
 
 
144 aa  136  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 
143 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  54.2 
 
 
149 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  56.15 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  55.3 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  57.36 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  55.38 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  51.13 
 
 
143 aa  132  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  50 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  54.4 
 
 
130 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  50 
 
 
171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  51.16 
 
 
171 aa  124  6e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  51.11 
 
 
146 aa  124  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
135 aa  115  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  51.56 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  52 
 
 
132 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 
137 aa  107  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  50.4 
 
 
139 aa  107  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
156 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  44.44 
 
 
137 aa  97.1  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  45.74 
 
 
229 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
157 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
164 aa  89  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  44.96 
 
 
229 aa  88.6  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  40.6 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
240 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
231 aa  85.1  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 
151 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  37.69 
 
 
237 aa  84.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
151 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
151 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
228 aa  81.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
252 aa  77.8  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  40.46 
 
 
252 aa  77.4  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
178 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  40.31 
 
 
229 aa  73.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
186 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
153 aa  72  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
219 aa  70.9  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  45.65 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.94 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 
273 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.68 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  41.8 
 
 
226 aa  67.4  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
141 aa  67  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 
232 aa  67  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 
164 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  47.76 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 
284 aa  64.7  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
269 aa  64.7  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  46.38 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  47.14 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  32.21 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 
239 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  38.95 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  32.58 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  24.69 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 
303 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>