More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0131 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  60.9 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  60.9 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 155 aa  191  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  55.19 
 
 		 155 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  56.13 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  53.25 
 
 		 155 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  51.61 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  53.21 
 
 		 156 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  50.64 
 
 		 159 aa  163  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  49.66 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  46.26 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 142 aa  88.2  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  36.48 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  30.19 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.94 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  40.46 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  36.45 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.03 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  31.09 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  31.09 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  31.09 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  30.43 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.62 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  32.62 
 
 		 159 aa  74.3  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32.62 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  33.09 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  32.73 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  33.33 
 
 		 530 aa  70.5  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  39.81 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  34.11 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5571  NUDIX hydrolase  37.58 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0243609  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.24 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  31.94 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.07 
 
 		 151 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.85 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  31.54 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3370  MutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312506  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  31.54 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.07 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  46.58 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  32.06 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.34 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3137  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0554874  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3352  phosphohydrolase  29.93 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  28.03 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1879  mutT/nudix family protein  32.12 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  35.65 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>