More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1385 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  100 
 
 
209 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 
209 aa  228  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  47.55 
 
 
205 aa  195  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  40.59 
 
 
205 aa  192  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  40.1 
 
 
205 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  40.1 
 
 
205 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  40.1 
 
 
205 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  40.1 
 
 
205 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  39.6 
 
 
205 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  40.1 
 
 
205 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  38.12 
 
 
205 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  38.12 
 
 
205 aa  185  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 
205 aa  182  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  37.62 
 
 
204 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
215 aa  155  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  45.03 
 
 
194 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  33 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  41.41 
 
 
218 aa  139  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  43.07 
 
 
216 aa  138  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  33.16 
 
 
207 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  36.32 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  36.36 
 
 
206 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  33.49 
 
 
222 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  35.5 
 
 
220 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1029  mutT/nudix family protein, truncation  46.84 
 
 
83 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.320813  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.76 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 
155 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
155 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
132 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
164 aa  62.8  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 
146 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
174 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  30.33 
 
 
144 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  30.36 
 
 
153 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 
149 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  48.48 
 
 
158 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 
140 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
182 aa  59.3  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  29.57 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 
153 aa  59.3  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 
149 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  29.57 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  33.65 
 
 
156 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 
136 aa  58.5  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  32.76 
 
 
184 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
141 aa  58.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
171 aa  58.2  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
158 aa  58.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  31.82 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
181 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 
173 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
151 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
143 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
153 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  31.9 
 
 
183 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  31.9 
 
 
181 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
188 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>