274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0453 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  100 
 
 
215 aa  437  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  55.07 
 
 
205 aa  226  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  51.21 
 
 
205 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  42.64 
 
 
205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  43.15 
 
 
205 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  43.15 
 
 
205 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  42.64 
 
 
205 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  41.79 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  41.79 
 
 
205 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  42.64 
 
 
205 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  41.29 
 
 
205 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  41.62 
 
 
205 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  41.75 
 
 
205 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  41.29 
 
 
205 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  47.18 
 
 
194 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  42.29 
 
 
207 aa  169  4e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  42.03 
 
 
209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  47.5 
 
 
218 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
210 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  36.95 
 
 
204 aa  157  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  42.36 
 
 
206 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
206 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
216 aa  147  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  41.75 
 
 
220 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
205 aa  141  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 
209 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  40.1 
 
 
212 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 
222 aa  124  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  32.06 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1029  mutT/nudix family protein, truncation  36.71 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.320813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 
160 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
155 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
155 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
166 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
155 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
142 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 
157 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.58 
 
 
156 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
153 aa  58.2  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
156 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
156 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  26.96 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
155 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  39.19 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
171 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  28.93 
 
 
181 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 
159 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  25 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
162 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
161 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  25 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  30.63 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
169 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.57 
 
 
530 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  25 
 
 
153 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
134 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.57 
 
 
163 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
141 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
163 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
153 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  30.3 
 
 
171 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  30.3 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
143 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 
181 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0752  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 
400 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 
187 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
146 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
155 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
158 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  26.27 
 
 
149 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  25 
 
 
155 aa  49.3  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  27.64 
 
 
156 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  25.77 
 
 
190 aa  48.9  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3755  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
157 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  29.66 
 
 
173 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  24.07 
 
 
153 aa  48.9  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  32.74 
 
 
524 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  29.29 
 
 
163 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 
160 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
162 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3954  mutator MutT protein  44.68 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380567  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  27.05 
 
 
181 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
157 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>