277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1838 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  100 
 
 
230 aa  454  1e-127  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  32.96 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 
215 aa  91.7  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  32 
 
 
205 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 
205 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  32 
 
 
205 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  31.43 
 
 
205 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  28.97 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
205 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  30.86 
 
 
205 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
209 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  30.86 
 
 
205 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
205 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  26.64 
 
 
204 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 
205 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  32.57 
 
 
205 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  30.62 
 
 
206 aa  82.4  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.26 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  30.51 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30.9 
 
 
212 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  35.11 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  31.58 
 
 
149 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  28.02 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.09 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 
140 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  30.25 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.09 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.7 
 
 
156 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 
155 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  33.33 
 
 
155 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 
155 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 
160 aa  62.4  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
157 aa  62  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
163 aa  62  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
161 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0219  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
158 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.450694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
156 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  36.46 
 
 
141 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0682  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
156 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132833  normal  0.0334373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  42.2 
 
 
139 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
149 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
153 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
143 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  25.97 
 
 
164 aa  59.3  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 
157 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 
155 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.41 
 
 
149 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  32.54 
 
 
167 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  29.2 
 
 
530 aa  58.5  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
163 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 
160 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
162 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  34.4 
 
 
156 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  32.46 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 
155 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1730  ADP-ribose pyrophosphatase  33.93 
 
 
151 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
150 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 
142 aa  55.5  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
141 aa  54.7  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
149 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.19 
 
 
147 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
156 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
156 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
153 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  32.58 
 
 
141 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
148 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  30.28 
 
 
147 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0589  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
141 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000226266  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
146 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.36 
 
 
159 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  43.33 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  29.46 
 
 
158 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
158 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
179 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 
143 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
270 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>