More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3707 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  88.36 
 
 		 149 aa  263  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  72.06 
 
 		 151 aa  173  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  54.07 
 
 		 147 aa  139  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  46.72 
 
 		 174 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 270 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 270 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  43.26 
 
 		 270 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  41.86 
 
 		 430 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  41.3 
 
 		 206 aa  94.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  41.86 
 
 		 258 aa  94.4  5e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 174 aa  94  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 182 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  93.6  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  44.85 
 
 		 203 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  42.65 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 268 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 282 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  42.11 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 302 aa  91.3  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  44.23 
 
 		 272 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  39.71 
 
 		 205 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 158 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  43.48 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 182 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  35.94 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.15 
 
 		 315 aa  80.5  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  32.31 
 
 		 577 aa  75.5  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 583 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  38.35 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 166 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 351 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 311 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 289 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 311 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 311 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  35.77 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 322 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 301 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  39.1 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  31.2 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  32.62 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 		 314 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 310 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  30.46 
 
 		 199 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1639  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000053664  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  39.29 
 
 		 325 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 		 536 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  32.76 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  35.45 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  29.66 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  32.85 
 
 		 322 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  32.08 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  36.52 
 
 		 424 aa  57  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  33.58 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  28.47 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  28.03 
 
 		 315 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 326 aa  53.9  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 303 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  30.19 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  29.85 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  30.19 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>