More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1350 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  100 
 
 
143 aa  278  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 
134 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
126 aa  110  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  47.24 
 
 
139 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  42.06 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  40 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  42.11 
 
 
473 aa  79.7  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 
162 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  40.52 
 
 
146 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  40.16 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
180 aa  74.7  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 
147 aa  74.3  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  41.9 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  39.16 
 
 
163 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  40 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  38.76 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.52 
 
 
355 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  40.17 
 
 
318 aa  68.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  36.64 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  38.17 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  42.31 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  42.31 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.52 
 
 
349 aa  67.4  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  42.31 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  36.13 
 
 
147 aa  67  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  40.18 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  37.29 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  48.18 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  39.13 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
154 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  40 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  32.48 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  38.66 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.39 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  40.8 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
182 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  35.04 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  37.72 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  36.44 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  35.54 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  37.72 
 
 
145 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
144 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  35.43 
 
 
329 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.21 
 
 
163 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  35.43 
 
 
329 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  41.18 
 
 
570 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  36.44 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  38.68 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 
305 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 
178 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  53.33 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
137 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2431  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
132 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00584965  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
187 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  32.23 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  60.8  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
361 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
151 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  39.83 
 
 
315 aa  61.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  36.18 
 
 
315 aa  61.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>