More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3076 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3076  NUDIX hydrolase  100 
 
 
216 aa  421  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0685  NUDIX hydrolase  56.34 
 
 
218 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1799  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 
205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000483875  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0773  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
205 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195628  hitchhiker  0.00363366 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1385  NUDIX hydrolase  42.93 
 
 
209 aa  149  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1536  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 
205 aa  145  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.058172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2116  mutT/nudix family protein  36.68 
 
 
205 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.610477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  36.32 
 
 
205 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  36.32 
 
 
205 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2079  mutT/nudix family protein  36.32 
 
 
205 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  43.72 
 
 
194 aa  141  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 
215 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1853  MutT/NUDIX family hydrolase  36.04 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.252059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2148  mutT/nudix family protein  36.55 
 
 
205 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.992633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1863  MutT/NUDIX family hydrolase  35.53 
 
 
205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2037  mutT/nudix family protein  36.04 
 
 
205 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3272  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 
205 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
210 aa  137  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1897  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.018697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1205  NUDIX family hydrolase  31.6 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00320321  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0946  ADP-ribose pyrophosphatase  32.86 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000804497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5350  NUDIX hydrolase  33.18 
 
 
205 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.46762  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  35.64 
 
 
212 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  40.67 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5155  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 
222 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.418641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  36.79 
 
 
220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  30.81 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  35.86 
 
 
206 aa  104  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  34.71 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  33.88 
 
 
153 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  33.06 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1838  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  35.25 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 
162 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  38.62 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  36.09 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
155 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  33.09 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  30.66 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.89 
 
 
156 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
142 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 
161 aa  63.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  33.81 
 
 
155 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  33.53 
 
 
188 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  35.77 
 
 
144 aa  62.8  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  51.92 
 
 
96 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  33.96 
 
 
149 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
155 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 
157 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 
156 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 
158 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  34.48 
 
 
145 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1249  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
156 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0794  NUDIX family hydrolase  37.7 
 
 
171 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 
162 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0782  MutT/nudix family protein, putative  37.7 
 
 
171 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.180522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  31.73 
 
 
149 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  31.73 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  30.28 
 
 
143 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  31.73 
 
 
149 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
157 aa  58.9  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
139 aa  58.9  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  31.73 
 
 
140 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  31.73 
 
 
149 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0215  ADP-ribose pyrophosphatase  34.13 
 
 
173 aa  58.9  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0696282  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
156 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 
156 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  35.87 
 
 
147 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  33.62 
 
 
145 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  32.76 
 
 
145 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3803  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122492  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
145 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 
137 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1682  SH3-like region  26.81 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00241886  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  26.61 
 
 
133 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1178  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0049447  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
145 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  33.04 
 
 
145 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
144 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 
174 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  35.11 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>