More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4163 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 133 aa  276  9e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  66.17 
 
 		 133 aa  183  5e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  63.7 
 
 		 135 aa  183  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  64.44 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  64.44 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  64.44 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  66.42 
 
 		 134 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  61.19 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3895  NUDIX hydrolase  57.62 
 
 		 151 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4018  NUDIX hydrolase  55.84 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  61.31 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  39.74 
 
 		 153 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  39.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  34.06 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0616  mutT/nudix family protein  39.74 
 
 		 169 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189637  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  35.59 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  35.29 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  31.62 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  33.66 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  30.84 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.02 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  34.75 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  33.66 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  34.02 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  46.67 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  30.89 
 
 		 220 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  34.18 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.11 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  27.59 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.44 
 
 		 530 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  33.98 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  36.14 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  30.83 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  41.56 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  43.84 
 
 		 147 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  40.28 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  40.28 
 
 		 145 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  45.76 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  45.76 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  27.93 
 
 		 147 aa  52  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>