More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3228 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 122 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  96.72 
 
 		 122 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3429  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3754  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  35.83 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  37.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  37.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  37.36 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  41.38 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0697  MutT related protein  32.8 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.382229  normal  0.361701 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01990  ADP-ribose pyrophosphatase  34.26 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0760  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  35.78 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2716  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  36.36 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  30.39 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  35.16 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  36.26 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  33.67 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  34.51 
 
 		 570 aa  51.2  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  32.67 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.02 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  30.77 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  28.43 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  37.74 
 
 		 315 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.03 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2227  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 294 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  31.71 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2448  MutT/nudix family protein  36.36 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3483  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2940  mutT-like protein  38.46 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.703961  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1878  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2100  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00137936  normal  0.649808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1687  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  43.48 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  42.86 
 
 		 316 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.86 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  24.56 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1921  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.11755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0906  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 187 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3691  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  31.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  31.33 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  33.64 
 
 		 282 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  42.62 
 
 		 212 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  31.96 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  36.9 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0324  NUDIX hydrolase  28.43 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2327  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  34.17 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  46.55 
 
 		 272 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 156 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1456  MutT/nudix family protein  34.52 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000100507  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1933  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.39617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 298 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  32.5 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1582  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 261 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2443  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 176 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1094  phosphohydrolase (MutT/nudix family protein)  34.91 
 
 		 260 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.10735  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  52.94 
 
 		 312 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2327  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.345384  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2019  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.172298  hitchhiker  0.00570807 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  32.98 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>