More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5001 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  79.49 
 
 		 156 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  69.78 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  67.39 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  61.07 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  53.69 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  58.11 
 
 		 193 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  51.28 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  53.02 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  52.03 
 
 		 169 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  53.19 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  48.61 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  48.61 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  52.99 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  54.14 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  53.73 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  35.34 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  44.78 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  29.81 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  29.91 
 
 		 229 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 153 aa  50.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0457  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0641725  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1980  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.280065 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1811  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3866  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.190486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0596  mutT/nudix family protein  32.71 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000504952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0511  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0633443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0450  MutT/NUDIX family protein  31.45 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 137 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2756  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0542  mutT/nudix family protein  31.45 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000238457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  43.1 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  34.65 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 134 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1752  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00295797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 136 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.02 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  35.05 
 
 		 130 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.2 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  48.89 
 
 		 218 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0454  MutT/NUDIX family protein  32.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000159368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0542  mutT/nudix family protein  32.71 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16009e-47 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  48.94 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  31.97 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  38.37 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0578  mutT/nudix family protein  31.78 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000245736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  28.04 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0234  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.425088  normal  0.397447 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  29.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  34.86 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  29.09 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>