267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1261 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 289 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  75.09 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  41.11 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  46.18 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  41.12 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  40.42 
 
 		 292 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 311 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  40.69 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  40.68 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 310 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 314 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.54 
 
 		 315 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 303 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  43.5 
 
 		 303 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  44.44 
 
 		 325 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  40.79 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  35.14 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 302 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  39.37 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  37.28 
 
 		 351 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.43 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4264  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  34.62 
 
 		 336 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  36.65 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  34.93 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  38.11 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  41.15 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  35.37 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0081  hydrolase, NUDIX family  27.85 
 
 		 398 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000209436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2236  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.592107  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1592  NTP pyrophosphohydrolase for oxidative damage repair  31.6 
 
 		 395 aa  93.6  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.985327  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  47.33 
 
 		 139 aa  91.3  2e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 211 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.17 
 
 		 577 aa  66.6  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  40.19 
 
 		 147 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 138 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  32.82 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 146 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  40.74 
 
 		 151 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  38.13 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  42.11 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  33.86 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  30.3 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  31.25 
 
 		 160 aa  55.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 143 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  30.97 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 139 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 158 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 143 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  44.57 
 
 		 154 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  31.09 
 
 		 141 aa  53.9  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  31.54 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  32.33 
 
 		 205 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 206 aa  53.5  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 151 aa  53.1  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.03 
 
 		 583 aa  53.1  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 268 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 140 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  31.73 
 
 		 146 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  27.27 
 
 		 430 aa  52  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  33.93 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3705  mutT/nudix family protein  29.57 
 
 		 137 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 219 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  40.51 
 
 		 172 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2802  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 159 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.44267  hitchhiker  0.00236205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  31.85 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 164 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0152  mutT/Nudix family protein  28.45 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>