143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4563 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 166 aa  341  2e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 		 149 aa  74.7  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  40.94 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  39.45 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 143 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 305 aa  67.4  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 314 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  29.5 
 
 		 577 aa  62.4  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 311 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  40.66 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 310 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  40.95 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  37.86 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.71 
 
 		 315 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  45.31 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  29.32 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  28.79 
 
 		 583 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 299 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.61 
 
 		 292 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 351 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 282 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  37.8 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 268 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  30.22 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 139 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 302 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 148 aa  51.6  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  31.75 
 
 		 317 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0876  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 333 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.679959  hitchhiker  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2125  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 143 aa  50.8  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 216 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  31.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  28.68 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 322 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0673  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.51908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 		 143 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  30.84 
 
 		 205 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 341 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 302 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 182 aa  48.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 206 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1993  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  29.69 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 301 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  32.29 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  26.9 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 207 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  32.41 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 324 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2356  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  43.1 
 
 		 142 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 143 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3496  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 322 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  41.43 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5221  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 333 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.239365  normal  0.144046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>