222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1465 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1465  NUDIX hydrolase  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.650531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2605  NUDIX hydrolase  36.14 
 
 
216 aa  125  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.700419  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0237  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 
229 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.619114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  37 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1155  hypothetical protein  42.57 
 
 
231 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1466  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10731  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
194 aa  111  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07956  AP4A hydrolase  40.71 
 
 
208 aa  105  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2668  hypothetical protein  40.29 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
229 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  36.94 
 
 
143 aa  60.1  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  31.1 
 
 
258 aa  58.2  0.00000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  38.74 
 
 
142 aa  55.5  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
137 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  28.35 
 
 
129 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  29.75 
 
 
314 aa  53.1  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 
144 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  28.3 
 
 
430 aa  50.8  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.68 
 
 
155 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  35 
 
 
150 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
140 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2080  NUDIX hydrolase  38.54 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.397171  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  31.54 
 
 
164 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
315 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36 
 
 
156 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
155 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0812  NUDIX hydrolase  30.09 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00112519  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  31.58 
 
 
424 aa  48.5  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17440  ADP-ribose pyrophosphatase  31.91 
 
 
336 aa  48.5  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.303863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 
137 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  31.16 
 
 
305 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
322 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  27.45 
 
 
151 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  39.44 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  39.44 
 
 
159 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
170 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  31.73 
 
 
140 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  31.73 
 
 
140 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.23 
 
 
360 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
351 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  44 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2727  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00813927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
156 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  36 
 
 
158 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0910  NUDIX hydrolase  30.59 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.479251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 
153 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  30 
 
 
134 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  32 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32 
 
 
156 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  26.24 
 
 
144 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
296 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  43.1 
 
 
169 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00240  deadenylation-dependent decapping-related protein, putative  30 
 
 
888 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.390509  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  37.93 
 
 
141 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
122 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
140 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  41.07 
 
 
122 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00520  ADP-ribose pyrophosphatase  30.67 
 
 
145 aa  45.8  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.129301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2635  hypothetical protein  30.91 
 
 
313 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
151 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
143 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
289 aa  45.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4795  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.223434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4636  Nudix hydrolase  37.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5158  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.972651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3209  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 
134 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0097  NUDIX hydrolase  32 
 
 
151 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5069  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5035  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2053  MutT/nudix family protein  32.95 
 
 
132 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.381111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5063  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  27.2 
 
 
158 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4656  Nudix hydrolase  37.68 
 
 
168 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35.53 
 
 
132 aa  45.1  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
124 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  26.06 
 
 
155 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0178  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  45.1  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2650  hypothetical protein  25.9 
 
 
315 aa  45.1  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  34.12 
 
 
147 aa  45.1  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2246  NUDIX hydrolase  26.55 
 
 
168 aa  44.7  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.171331  decreased coverage  0.0000730626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  48.78 
 
 
122 aa  45.1  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 
139 aa  45.1  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  30 
 
 
139 aa  44.7  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  30.77 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
167 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  27.36 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5064  mutT/nudix family protein  37.68 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3536  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2516  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 
130 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  41.82 
 
 
324 aa  44.3  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>