More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1730 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  100 
 
 
137 aa  275  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  52.89 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  52.89 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  52.89 
 
 
136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  45.07 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  41.22 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
135 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 
158 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
140 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  40.62 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
149 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  39.13 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  41.03 
 
 
337 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  37.39 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  36.44 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  34.35 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.62 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  36.23 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 
141 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  32.82 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  33.07 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  32.06 
 
 
169 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  33.62 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  35.59 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  28.23 
 
 
141 aa  62.8  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
161 aa  62.8  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
146 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  35.65 
 
 
163 aa  61.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 
155 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  33.09 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  47.62 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
142 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  40.79 
 
 
163 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40.79 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
142 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40.79 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40.79 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
159 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
165 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4127  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
167 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0317777  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  40.34 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  41.67 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  28.97 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  29.32 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  34.06 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  32.35 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  29.85 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  31.09 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
199 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.12 
 
 
363 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.85 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  29.92 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8468  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  39.5 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1946  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.97992  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  31 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
168 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  30 
 
 
240 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
162 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  38.75 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  30.6 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0306  hypothetical protein  36.36 
 
 
321 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
154 aa  53.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  31.03 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35 
 
 
194 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 
179 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  35.94 
 
 
314 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  39.64 
 
 
524 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  30.14 
 
 
352 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
167 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2195  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.78 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>