More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2686 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  100 
 
 
151 aa  315  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  99.34 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  99.34 
 
 
151 aa  311  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 
140 aa  189  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  45.38 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  42.86 
 
 
137 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  41.01 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  40.58 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  40.68 
 
 
163 aa  90.9  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  39.13 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  35 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29.23 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  29.5 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.9 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  28.78 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
171 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  31.36 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  28.78 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  28.78 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2605  mutT/nudix family protein  28.78 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000292929 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  35.77 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.69 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2719  mutT/nudix family protein  30.65 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00471958  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  33.9 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  33.9 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.69 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.69 
 
 
175 aa  63.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  44.93 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  33.9 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  28.23 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  28.23 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  28.23 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  35.59 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  28.06 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  35 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  44.62 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  28.81 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  44.62 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
158 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1355  putative MutT-family protein  32.71 
 
 
118 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  44.62 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  34.45 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3352  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
170 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 
153 aa  61.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
176 aa  61.6  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  44.62 
 
 
175 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  42.86 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.37 
 
 
159 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.15 
 
 
177 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
184 aa  61.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 
157 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  32.77 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3081  mutT/nudix family protein  29.31 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000075135 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.54 
 
 
175 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2371  mutT/nudix family protein  28.45 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0511564  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.09 
 
 
137 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.15 
 
 
178 aa  60.5  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  47.54 
 
 
175 aa  60.5  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3480  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  35.4 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4760  mutT/nudix family protein  29.61 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000960716  hitchhiker  5.01668e-23 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  31.58 
 
 
337 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>