More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2044 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  285  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  54.62 
 
 		 161 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  49.57 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3067  NUDIX hydrolase  52.55 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  49.59 
 
 		 163 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 		 168 aa  97.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  45.77 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  45.77 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  45.77 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  46.53 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  38.51 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 180 aa  77  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1017  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.803103  normal  0.224803 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 155 aa  68.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  38.21 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1089  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  39.34 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  40.16 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  38.64 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0716  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1870  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0662124  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  37 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2155  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.028212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.63 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  34.51 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  37 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 352 aa  58.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 		 352 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1352  NUDIX family hydrolase  35.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.468385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1336  NUDIX family hydrolase  35.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0415939 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1949  hydrolase, NUDIX family  35.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1314  NUDIX family hydrolase  35.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0824  NUDIX hydrolase  44.66 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.612559  hitchhiker  0.000224465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 302 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  28.93 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  37.61 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1977  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.35 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2086  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.35 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.16532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2787  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2341  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.35 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000814495  normal  0.025223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  28.1 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  40 
 
 		 570 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1484  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  41.76 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 		 473 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2131  NUDIX family hydrolase  34.23 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480915 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  32.79 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0963  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.7 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01132  bifunctional thiamin pyrimidine pyrophosphate hydrolase/ thiamin pyrophosphate hydrolase  32.46 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1487  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000137627 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01140  hypothetical protein  32.46 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 		 386 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>