More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_28290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_28290  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00379954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2466  hypothetical protein  84.09 
 
 		 136 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  52.34 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  50.79 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_93251  predicted protein  45.31 
 
 		 148 aa  100  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  38.46 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4889  hypothetical protein  45.45 
 
 		 337 aa  94  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49101  predicted protein  39.85 
 
 		 174 aa  91.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00569442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  38.76 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2765  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000522672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1522  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  38.76 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.596031  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2121  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575199  decreased coverage  0.00514227 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2429  mutT like protein  39.32 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1479  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142432  hitchhiker  0.00620383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0371  ADP-ribose pyrophosphatase  40.52 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0357  ADP-ribose pyrophosphatase  40.52 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0547  MutT/NUDIX family protein  40.52 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2251  NUDIX hydrolase  36.13 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  54.24 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  35.59 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.33 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  32 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  34.19 
 
 		 137 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2554  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  47.46 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2614  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  36.13 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  54.39 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1992  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0853  normal  0.178194 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0900  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2547  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  52.54 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2036  NUDIX hydrolase  51.52 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0028  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  45.76 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3789  mutator MutT protein  29.84 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  32.2 
 
 		 360 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  32.58 
 
 		 363 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  45.9 
 
 		 342 aa  52  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.23 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4668  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2798  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.74 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.779042  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2289  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2817  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.30538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3237  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778002  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 		 187 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  34.44 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 155 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2042  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4299  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  28.26 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.78 
 
 		 134 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0869  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.11667  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  28.15 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2698  mutT/nudix family protein  28.15 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000763334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2105  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2044  MutT/Nudix family protein  27.34 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00937843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  28.15 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  38.1 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4793  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40.32 
 
 		 346 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0447007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2286  mutT/nudix family protein  27.34 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02194e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  38.55 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  31.01 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>