261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2799 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  100 
 
 
159 aa  329  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  90.51 
 
 
158 aa  300  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2282  NUDIX hydrolase  60 
 
 
163 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.725543  normal  0.213019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3242  hypothetical protein  68.03 
 
 
132 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2186  NUDIX hydrolase  50.66 
 
 
165 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  53.1 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  51.03 
 
 
151 aa  146  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  51.03 
 
 
151 aa  146  9e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  49.33 
 
 
156 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4874  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
162 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2633  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 
162 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.748492  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5001  NUDIX hydrolase  48.67 
 
 
156 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  48.59 
 
 
193 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3051  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2258  putative NUDIX hydrolase  49.63 
 
 
173 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4195  NUDIX hydrolase  46.81 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.566986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4049  NUDIX hydrolase  48.23 
 
 
169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  46.21 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3674  NUDIX hydrolase  43.83 
 
 
175 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3476  NUDIX hydrolase  42.68 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3784  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  41.26 
 
 
156 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2221  NUDIX hydrolase  44.52 
 
 
146 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.25917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  41.96 
 
 
156 aa  117  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.58 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2655  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3444  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 
179 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  35.19 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1730  NUDIX hydrolase  34.4 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0618  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
166 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  31.2 
 
 
168 aa  53.9  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2394  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
191 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.772855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0453  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
215 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
169 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
163 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.39 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1593  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  30.33 
 
 
212 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3045  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  27.82 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3372  mutT/nudix family protein  27.82 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0523  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
187 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.329737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  40 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  25.2 
 
 
229 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0503  ADP-ribose pyrophosphatase  40.35 
 
 
206 aa  48.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 
199 aa  48.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  25.2 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1033  NUDIX hydrolase  30.36 
 
 
542 aa  47.4  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0906744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 
151 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0784  NUDIX hydrolase  23.44 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1874  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 
206 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000557306  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  28.21 
 
 
150 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  24.39 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2429  NUDIX hydrolase  25.62 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0417103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1029  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  24.39 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3076  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  24.39 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  40 
 
 
530 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.64 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  27.64 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
218 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.64 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0631  NUDIX hydrolase  29.23 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1914  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.592421  normal  0.977797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  27.64 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 
169 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  28.57 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  32.38 
 
 
317 aa  45.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  30.77 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  31.09 
 
 
396 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0503  putative mutator mutt protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  47.06 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.213775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3701  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
144 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.899383  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2153  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.399297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  28.45 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0407  mutator MutT protein  37.1 
 
 
129 aa  44.7  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  36.99 
 
 
314 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1860  NUDIX hydrolase  24.39 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00730748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3374  MutT/nudix family protein  31.9 
 
 
149 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00196022  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  36.99 
 
 
314 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0336257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>