223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6007 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  75.41 
 
 
124 aa  187  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  55.74 
 
 
126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  50 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  49.02 
 
 
147 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
140 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
141 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 
141 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 
203 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  41.03 
 
 
141 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  45.38 
 
 
158 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
122 aa  101  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 
141 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
140 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
185 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
142 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  40.4 
 
 
185 aa  98.2  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 
140 aa  97.4  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  47.01 
 
 
132 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 
137 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
183 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  38.94 
 
 
146 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 
120 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
130 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  38.26 
 
 
128 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  40 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  41.51 
 
 
758 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  36.19 
 
 
132 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  34 
 
 
105 aa  57.4  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
141 aa  57.4  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  34.45 
 
 
160 aa  54.3  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
150 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  26.96 
 
 
140 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 
170 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1185  ADP-ribose pyrophosphatase  29.6 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.792217  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  39.34 
 
 
132 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  28.97 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3063  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.375393 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2799  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  0.0516272 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  28.79 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0595  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.652543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  28 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
146 aa  48.5  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
162 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
136 aa  47.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  28.93 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  28.93 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  26.24 
 
 
150 aa  47.4  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3460  mutT/nudix family protein  25.19 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284792  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  33.05 
 
 
147 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3377  MutT/NUDIX family phosphohydrolase  26.89 
 
 
137 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  32.77 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  27.68 
 
 
137 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3732  mutT/nudix family protein  25.19 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
168 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.93 
 
 
142 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 
139 aa  47  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  37.1 
 
 
147 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3688  mutT/nudix family protein  25.19 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.237209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
182 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  35.58 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.25 
 
 
143 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  27.48 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1900  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2047  mutT/nudix family protein  27.78 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  27.2 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3357  NUDIX hydrolase  26.72 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  31.03 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  35.48 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.09 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2749  mutT/nudix family protein  28.44 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000217381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  29.59 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
155 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2498  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2429  MutT/Nudix family protein  29.79 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  35.48 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2683  mutT/nudix family protein  28.18 
 
 
147 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>