273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2082 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 146 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  53.97 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 203 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  46.9 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  46.34 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 122 aa  103  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.36 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  43.97 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  42.24 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  42.61 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 132 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  47.41 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 185 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 185 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  41.59 
 
 		 185 aa  89.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 183 aa  87.8  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 130 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.71 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  37.21 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  35.65 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  37.14 
 
 		 758 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3984  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 167 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.99462  decreased coverage  0.00100111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  39.22 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  32.32 
 
 		 147 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  26.98 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  27.87 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  41.98 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  28.45 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  40 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  31.62 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  41.07 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4817  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688995  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 174 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  28.12 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  25.49 
 
 		 154 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  28.3 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2108  NUDIX hydrolase  47.46 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000452555  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  35 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  24.83 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  26.12 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  29.9 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  35 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0222  NADH pyrophosphatase  29.59 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.740149  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  28.57 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  29.9 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  37.97 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  30.19 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  29.9 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  26.5 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>