More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7080 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7080  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 174 aa  337  7e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  74.07 
 
 		 169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5774  NUDIX hydrolase  67.52 
 
 		 270 aa  201  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.528861 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5398  NUDIX hydrolase  67.52 
 
 		 270 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5487  NUDIX hydrolase  67.52 
 
 		 270 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0844  NUDIX hydrolase  64.07 
 
 		 282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0803503  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  74.29 
 
 		 158 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6062  NUDIX hydrolase  65.36 
 
 		 268 aa  191  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107373 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4841  NUDIX hydrolase  62.5 
 
 		 272 aa  189  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13943  hypothetical protein  64.43 
 
 		 248 aa  184  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00635151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4224  NUDIX hydrolase  59.28 
 
 		 302 aa  181  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  70.29 
 
 		 151 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4208  NUDIX hydrolase  57.83 
 
 		 174 aa  168  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7322  NUDIX hydrolase  61.15 
 
 		 141 aa  155  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4495  NUDIX hydrolase  55.06 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.031023  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37900  ADP-ribose pyrophosphatase  58.04 
 
 		 205 aa  150  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.525356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3713  NUDIX hydrolase  57.42 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.639484  normal  0.0437167 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3925  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 182 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2543  NUDIX hydrolase  57.34 
 
 		 206 aa  147  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.339179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4158  NUDIX hydrolase  49.4 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  46.54 
 
 		 430 aa  140  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  54.61 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  45.18 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3363  NUDIX hydrolase  52.7 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23350  ADP-ribose pyrophosphatase  51.05 
 
 		 203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0612  NUDIX hydrolase  43.23 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000326067  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  42.22 
 
 		 150 aa  94.4  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5809  NUDIX hydrolase  39.86 
 
 		 143 aa  94.4  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.180379  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  34.29 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  42.42 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2468  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0192019  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1924  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 311 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.804936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1970  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 311 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1904  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 311 aa  73.9  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2428  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00549514  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2138  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4202  NUDIX hydrolase  39.84 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.204262 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13000  hydrolase mutT1  38.68 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4224  NUDIX hydrolase  40.57 
 
 		 299 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.5733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 536 aa  68.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1029  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0325  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.414078  normal  0.0748688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  37.59 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1991  deoxyribose-phosphate aldolase  37.41 
 
 		 424 aa  64.7  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.306707  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.38 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  39.69 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  36.79 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1382  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  34.59 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6228  NUDIX hydrolase  27.42 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1191  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0927  NUDIX hydrolase  31.06 
 
 		 129 aa  57  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.227585 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  37.61 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  36 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  40.66 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1402  NUDIX hydrolase  40.22 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1197  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4051  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 315 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2881  NADH pyrophosphatase  28.78 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  26.5 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0878  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2845  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  34.62 
 
 		 315 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  43.04 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1169  NUDIX hydrolase  39.74 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03520  ADP-ribose pyrophosphatase  36.54 
 
 		 308 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.630054 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  36.28 
 
 		 145 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2333  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.23 
 
 		 131 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  39.56 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  37.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2459  MutT/Nudix family protein  31.9 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000023854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  39.56 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1535  mutT/nudix family protein  30.48 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0265399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  41.86 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  37.17 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0755  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.916011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8612  hypothetical protein  37.76 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0852  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.68 
 
 		 577 aa  53.1  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  27.4 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>