261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1582 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 142 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  99.3 
 
 		 142 aa  284  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  87.86 
 
 		 140 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  87.86 
 
 		 140 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  87.14 
 
 		 140 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  85.71 
 
 		 140 aa  241  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  81.45 
 
 		 137 aa  206  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  53.44 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  58.27 
 
 		 141 aa  153  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  58.68 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  58.68 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  49.59 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  49.19 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 183 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  44.83 
 
 		 122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  53.45 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  53.04 
 
 		 185 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  52.17 
 
 		 185 aa  107  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  48.7 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 		 203 aa  100  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  43.7 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  44.74 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  44.34 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  49.09 
 
 		 758 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 132 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  42.37 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  38.18 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0094  hypothetical protein  41.43 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  35.9 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  28.8 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  34.51 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2570  NUDIX hydrolase  37.27 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.240186  normal  0.520915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1511  MutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1563  MutT/nudix family protein  33.06 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.752749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1103  nudix hydrolase  30.3 
 
 		 524 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.426954 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1602  NUDIX hydrolase  30.65 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973125  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  28.81 
 
 		 284 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2415  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0325  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.75 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  34.58 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 239 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 239 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  28.57 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  43.28 
 
 		 240 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  30.16 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  29 
 
 		 105 aa  45.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  34.34 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  27.87 
 
 		 194 aa  44.7  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  43.14 
 
 		 154 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 178 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1651  NUDIX hydrolase  52.83 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  32.41 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1064  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.19 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.772748  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 233 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02246  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 		 233 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2965  mutT/nudix family protein  25.56 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223919  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34.74 
 
 		 229 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2461  MutT/Nudix family protein  37.5 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020561  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 228 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>