More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06372 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  270  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  48.65 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  39.2 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  39.32 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  36.22 
 
 		 137 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  39.09 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  35.43 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  39.25 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3467  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0122853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  33.07 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  32.5 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0617  hypothetical protein  40.2 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  33.88 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  38.38 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  29.37 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  37.04 
 
 		 399 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1778  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5229  NUDIX hydrolase  38.82 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal  0.044426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  38.78 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  38.78 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  32.31 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  33.7 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 		 398 aa  62  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  33.62 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  34.78 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  31.47 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  33.05 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  36.19 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  34.33 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 334 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0991  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  36.61 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5260  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5005  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4834  MutT/Nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4849  MutT/Nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5385  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5275  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.425135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5317  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5682  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5241  mutT/nudix family protein  29.63 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4949  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0488  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0501  NUDIX hydrolase  27.84 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0370899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  28.18 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2524  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.736999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.43 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3528  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.321169  normal  0.283085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  35.23 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  26.89 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3611  mutator MutT protein  31.62 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2189  thiamine monophosphate synthase  35.64 
 
 		 315 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.988337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  29.52 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  31.43 
 
 		 135 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  29.52 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  29.91 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00910  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1931  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0413  mutator MutT protein  31.9 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478582 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  34.17 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  32.69 
 
 		 136 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  30.48 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.48 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  32.38 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2458  NUDIX hydrolase  26.79 
 
 		 138 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  35.56 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  32.76 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  33.67 
 
 		 347 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3983  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>