296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  100 
 
 		 136 aa  267  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  65.89 
 
 		 398 aa  152  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0925  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  52.59 
 
 		 399 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3019  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0809676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  45.04 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3179  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.292191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1370  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 137 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1495  NUDIX hydrolase  48.53 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0340127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  49.23 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21220  uridine kinase  46.67 
 
 		 354 aa  87.4  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19205  hypothetical protein  41.22 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22000  NTP pyrophosphohydrolase  47.66 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  44.53 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1657  hypothetical protein  40.31 
 
 		 152 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.745316  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  43.2 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0214  NUDIX hydrolase  46.27 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  42.75 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  43.38 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0350  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1773  NUDIX hydrolase  45.95 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.292364  normal  0.252484 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0295  MutT/nudix family protein  43.4 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.173427  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0281  MutT/nudix family protein  43.4 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0812  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3058  NUDIX hydrolase  42.28 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2521  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1594  putative NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  53.23 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  50.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  50.82 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  50.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  50.82 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  36.19 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  50 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  50.82 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  50.82 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25790  ADP-ribose pyrophosphatase  39.42 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0229  putative MutT family protein  41.58 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  29.82 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  32.8 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4195  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3838  NUDIX hydrolase  46.97 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0218718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  40.58 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.68 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  41.18 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  37.68 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 155 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  48.33 
 
 		 318 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  49.02 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  40 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  45.31 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  41.94 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  31.2 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  30.89 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4321  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00183396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  46.67 
 
 		 320 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  46.67 
 
 		 320 aa  47.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2432  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  31.2 
 
 		 148 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  54.9 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3518  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 170 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6003  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 314 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.45495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40.68 
 
 		 314 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  31.62 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  40.32 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3059  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 		 174 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0446727  normal  0.591536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3223  NUDIX hydrolase  40.3 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  30.4 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1106  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00400603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>