More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0747 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  305  1.0000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  74.34 
 
 		 153 aa  236  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  73.03 
 
 		 153 aa  229  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  60.42 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  57.14 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  57.14 
 
 		 160 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  57.14 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  58.62 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 		 156 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  56.94 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  56.94 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  56.94 
 
 		 160 aa  166  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  56.46 
 
 		 157 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  55.78 
 
 		 156 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  56.94 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  55.1 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  53.06 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  54.42 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  54.86 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 146 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 340 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.58 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 324 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4077  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 185 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.811281  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.14 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  42.59 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  42.59 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  46.67 
 
 		 181 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  31.48 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  50.85 
 
 		 146 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0516  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.01 
 
 		 199 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  39.08 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  42.59 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3198  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.8 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00084868  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3331  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000146788  hitchhiker  0.005493 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3232  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000155637  hitchhiker  0.0000853193 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.34 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1338  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000650565  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  27.42 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  43.55 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3151  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000021359  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  46.15 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3168  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3217  dinucleoside polyphosphate hydrolase  26.15 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000360016  hitchhiker  0.00252549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  47.06 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3017  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28.8 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000442704  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  26.06 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  50.98 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02678  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000336855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0861  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3150  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000288941  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2976  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.85852e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0904  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000367518  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0885  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000193658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2977  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801466  hitchhiker  0.0062852 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02639  hypothetical protein  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000320087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4096  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580084  hitchhiker  0.00923204 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  36.11 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  30.53 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  38.03 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  38.03 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  47.06 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3032  dinucleoside polyphosphate hydrolase  25.38 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.33004e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  28 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3148  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  26.72 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  29.23 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 154 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  25.38 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.27 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 147 aa  47.8  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  33.06 
 
 		 187 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0542  (di)nucleoside polyphosphate hydrolase  25.62 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.411915  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  26.52 
 
 		 255 aa  47.8  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>