107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1389 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 324 aa  648    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1114  globin  57.64 
 
 		 151 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  60.25 
 
 		 153 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  54.3 
 
 		 154 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 155 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  51.27 
 
 		 165 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  49.69 
 
 		 160 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  48.81 
 
 		 166 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  52.47 
 
 		 163 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  50.92 
 
 		 155 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  51.95 
 
 		 174 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  47.53 
 
 		 154 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  48.45 
 
 		 154 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 163 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  47.17 
 
 		 164 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  50.31 
 
 		 154 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  45.68 
 
 		 162 aa  126  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 153 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  49.07 
 
 		 154 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  48.1 
 
 		 156 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  45.81 
 
 		 152 aa  123  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 154 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  43.48 
 
 		 166 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  47.77 
 
 		 157 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  47.77 
 
 		 157 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  47.77 
 
 		 157 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  46.41 
 
 		 155 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  44.65 
 
 		 160 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 168 aa  116  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  42.26 
 
 		 162 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 163 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  43.95 
 
 		 155 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1095  globin  43.84 
 
 		 150 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  39.18 
 
 		 172 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 162 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  41.1 
 
 		 155 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  36.77 
 
 		 154 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 		 154 aa  96.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0871  protein of unknown function DUF1271  30.28 
 
 		 599 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207432  normal  0.190699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0283  globin  31.72 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1450  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2478  globin  28.37 
 
 		 153 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000576201  hitchhiker  0.00350075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2903  globin  29.93 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0248  globin  27.62 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2414  globin  31.68 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.76431  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8342  Truncated hemoglobins-like protein  27.46 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.414904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  36.75 
 
 		 167 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  41.84 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 156 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  32.72 
 
 		 153 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4165  globin  32.04 
 
 		 128 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  34.33 
 
 		 153 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  38.78 
 
 		 160 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 156 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2816  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3850  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000122426  normal  0.0184241 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  35.35 
 
 		 149 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  37.76 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  37.76 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  37.76 
 
 		 160 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  37.76 
 
 		 157 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  37.76 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  37.76 
 
 		 160 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  35.9 
 
 		 158 aa  50.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3773  NUDIX hydrolase  28.82 
 
 		 161 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000523575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1111  NUDIX hydrolase  35.19 
 
 		 161 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.508433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 156 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  37.76 
 
 		 157 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2015  globin  33.33 
 
 		 121 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  30.56 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  32.21 
 
 		 341 aa  45.8  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0433  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.942987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  36.73 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  36.96 
 
 		 139 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 146 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  67.74 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  50.79 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 		 289 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 139 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  31.33 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3425  globin  35.53 
 
 		 173 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 137 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  43.9  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 143 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  45.71 
 
 		 165 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2581  globin  38.98 
 
 		 119 aa  43.5  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  64.52 
 
 		 135 aa  43.1  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2228  globin  25.6 
 
 		 153 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134976  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2457  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 		 168 aa  43.1  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.815124  normal  0.223342 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 145 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>