219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1132 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  26.92 
 
 
155 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11810  ADP-ribose pyrophosphatase  38.98 
 
 
131 aa  52  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 
156 aa  50.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  38.1 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0341  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
186 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1278  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  37.35 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4020  ADP-ribose pyrophosphatase  34.38 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5306  NUDIX hydrolase  32.58 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838276  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  36.11 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  34.57 
 
 
162 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  43.33 
 
 
536 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  32.67 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  32.67 
 
 
159 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  25 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1154  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 
124 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.271981  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2512  NUDIX hydrolase  26.45 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335914  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3425  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
161 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.70639  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14240  ADP-ribose pyrophosphatase  25.17 
 
 
182 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1673  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
175 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  30.95 
 
 
158 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  29.41 
 
 
360 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3228  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043036  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5139  NUDIX hydrolase  32.28 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.874502  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 
183 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4074  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 
161 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.999235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  22.22 
 
 
260 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  36.99 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  24.58 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  31.67 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  40.98 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  23.97 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1579  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.904804  normal  0.0162238 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  36.21 
 
 
169 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  24.58 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
167 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
239 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5143  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753323  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0995  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.575894  normal  0.946338 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  32.04 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1282  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 
136 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.838379  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
281 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  40 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  40 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  28.15 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2810  mutT/nudix family protein  28.69 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0728884  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  30.34 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  46.43 
 
 
135 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2902  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 
219 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00219034  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3063  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.253855  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  28.71 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0010  MutT/nudix family protein  31.43 
 
 
188 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  32.43 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  43.86 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  32.31 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  24.58 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  27.17 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0496  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  51.35 
 
 
238 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  34.43 
 
 
136 aa  44.7  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  36.21 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  32.53 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  20.83 
 
 
248 aa  44.7  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  25.22 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  23.96 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  25.35 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5080  NUDIX hydrolase  27.69 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
120 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 
230 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  28.28 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1544  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30.12 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  34.94 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4880  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 
238 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  24.79 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  27.27 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1277  hypothetical protein  32.14 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.744115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>