More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1103 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  100 
 
 
169 aa  335  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  49.01 
 
 
157 aa  141  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  45.7 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 
175 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  40 
 
 
156 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 
282 aa  94.4  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0064  putative ATP/GTP-binding protein  36.23 
 
 
157 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 
253 aa  91.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2415  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 
169 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000842745  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 
230 aa  89  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  48.31 
 
 
218 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0189  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 
161 aa  84.3  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6876  putative ATP/GTP-binding protein  37.66 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1537  hypothetical protein  30.97 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.156028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  35.62 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  38.79 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  47.46 
 
 
149 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
340 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  51.16 
 
 
172 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  32.04 
 
 
140 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  34.62 
 
 
140 aa  50.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  32.04 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
153 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  32.04 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  32.04 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  44.62 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  42.67 
 
 
136 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  30.85 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  32.04 
 
 
140 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  37.1 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  37.1 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  34.52 
 
 
134 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  52.17 
 
 
137 aa  49.3  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  31.07 
 
 
140 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
146 aa  48.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6646  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  51.06 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  45.9 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  45.9 
 
 
160 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  51.06 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  43.64 
 
 
143 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
156 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3625  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.74 
 
 
171 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.635767  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  45.28 
 
 
137 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1825  MutT/Nudix family protein  26.09 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1809  MutT/Nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00380434  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  47.62 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2030  mutT/nudix family protein  26.09 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.83484e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3330  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000371651  unclonable  1.49498e-25 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  36 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2094  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000267721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  42.37 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1556  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1132  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.62 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000912913  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  45.28 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0260  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 
303 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  31.73 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3605  NUDIX hydrolase  32.71 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.88 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4350  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1854  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  48.94 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1997  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000428877  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 
135 aa  45.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5012  NUDIX hydrolase  46 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615251  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  52.17 
 
 
132 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  36.21 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  50 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
130 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1999  mutT/nudix family protein  27.12 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00120864  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  33.63 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0203  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.19 
 
 
193 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  47.62 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  28.24 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  42.37 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2328  dinucleoside polyphosphate hydrolase  39.62 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.42836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004431  adenosine (5')-pentaphospho-(5'')-adenosine pyrophosphohydrolase  35.19 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000169211  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  37.18 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  39.44 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00967  dinucleoside polyphosphate hydrolase  35.19 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1092  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227714  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  34.85 
 
 
143 aa  44.7  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2007  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  46.94 
 
 
312 aa  44.7  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 
167 aa  44.7  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 
147 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 
153 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2310  dinucleoside polyphosphate hydrolase  37.04 
 
 
173 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>