199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0058 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  46.51 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6325  NUDIX hydrolase  48.48 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 141 aa  109  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  45.74 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  36.15 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 139 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  34.03 
 
 		 148 aa  92.4  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2319  NUDIX hydrolase  43.55 
 
 		 147 aa  88.6  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.734141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  49.18 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  36.63 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  32.77 
 
 		 143 aa  52  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 240 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  39 
 
 		 239 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 525 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  34.58 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  47.69 
 
 		 238 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 291 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  40.51 
 
 		 135 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29780  ADP-ribose pyrophosphatase  36.59 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  39.24 
 
 		 135 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 137 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  36.62 
 
 		 134 aa  48.5  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 147 aa  48.5  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  53.66 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 140 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 138 aa  48.5  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 156 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 169 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 133 aa  47.8  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  37.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  59.46 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  33.33 
 
 		 143 aa  47.8  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5787  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 238 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 282 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04292  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  33.61 
 
 		 351 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  33.82 
 
 		 118 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  56.41 
 
 		 146 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3378  NUDIX hydrolase  34.04 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6512  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.877846  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1790  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 154 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1132  NUDIX family hydrolase  29.63 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 253 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4359  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  59.46 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  58.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  58.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3974  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  58.33 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  58.33 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 142 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  32.97 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  58.33 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  58.33 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  58.33 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 		 134 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2984  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 136 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000021571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 143 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  50 
 
 		 142 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0439  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 154 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  54.29 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  45.71 
 
 		 316 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 148 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  56.76 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  45 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4226  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  50 
 
 		 137 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  47.06 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  50 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2885  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000755007  normal  0.649673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  31.4 
 
 		 314 aa  43.9  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4163  NUDIX hydrolase  47.73 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1713  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108614  normal  0.043111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2766  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3822  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 145 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  45.1 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64010  hypothetical protein  26.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>