More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0905 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2830  NUDIX hydrolase  84.56 
 
 		 149 aa  261  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282197  normal  0.0206964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1305  NUDIX family hydrolase  83.22 
 
 		 149 aa  259  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  78.23 
 
 		 160 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  78.23 
 
 		 160 aa  234  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1418  NUDIX domain-containing protein  76.87 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0891  NUDIX domain-containing protein  76.87 
 
 		 157 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0700  NUDIX domain-containing protein  76.87 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0460  NUDIX domain-containing protein  76.87 
 
 		 160 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.080692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  76.19 
 
 		 160 aa  228  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  75 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  68.21 
 
 		 167 aa  214  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 156 aa  208  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 156 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  66.89 
 
 		 156 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 		 157 aa  207  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  66.23 
 
 		 156 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0747  hypothetical protein  58.62 
 
 		 153 aa  167  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0763  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 		 153 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0534462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0697  NUDIX hydrolase  58.57 
 
 		 153 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.276525 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5641  NUDIX hydrolase  44.03 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  41.24 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  29.63 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1103  NUDIX hydrolase  49.15 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2202  NUDIX hydrolase  42.71 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  31.25 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  32.03 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  32.03 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  36.99 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3942  putative NUDIX-like hydrolase  42.42 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180458  normal  0.438057 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 340 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24710  ADP-ribose pyrophosphatase  30.83 
 
 		 255 aa  51.6  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  33.06 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 133 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  38.27 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  30.08 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  35.05 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1481  NUDIX hydrolase  38.55 
 
 		 301 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0468902  normal  0.959554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0037  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 229 aa  50.4  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  42.37 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5733  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 218 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8547  NUDIX hydrolase  38.6 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00677981  hitchhiker  0.000239658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3212  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 302 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.26915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  29.92 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0331  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.328868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  31.13 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  31.13 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  31.25 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  31.13 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  29.25 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  31.25 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1805  NUDIX hydrolase  47.27 
 
 		 253 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  44.64 
 
 		 347 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1651  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 194 aa  48.5  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  31.25 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  34.34 
 
 		 430 aa  48.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  27.48 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  30.07 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  32.65 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  30.19 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  29.85 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3492  NUDIX hydrolase  39.06 
 
 		 157 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 398 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  26.36 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2164  NUDIX hydrolase  38.2 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  35.48 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.71 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  39.19 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0815  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 230 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3748  dinucleoside polyphosphate hydrolase  27.78 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  24.06 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  26.77 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  29.25 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0149  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  33.67 
 
 		 324 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3106  NUDIX hydrolase  38 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  35.71 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>