More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2310 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 138 aa  280  7.000000000000001e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  68.15 
 
 		 149 aa  197  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  57.97 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  54.03 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  39.68 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.38 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.04 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0955  hypothetical protein  32.81 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4376  hypothetical protein  49.21 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  35.29 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1348  hypothetical protein  49.21 
 
 		 314 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000350959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1141  NUDIX hydrolase  34.81 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1718  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  33.33 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  32.31 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1377  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.054711  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  29.2 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4501  hypothetical protein  49.21 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523087  normal  0.745544 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  32.73 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0464  MutT/nudix family protein  33.64 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  31.82 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  32.33 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  32.73 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  51.67 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  36.07 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  32.73 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  34 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2971  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000073091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.87 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4181  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.487882  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  33.94 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  27.34 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1062  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  39.33 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4263  NUDIX hydrolase  46.88 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6695  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.412462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  28.91 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  36.26 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3918  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49136  normal  0.198135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  44.64 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3533  NUDIX family pyrophosphatase  38.1 
 
 		 334 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 473 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  37.78 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  37.97 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.67 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  36.26 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3309  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  40.96 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  46.03 
 
 		 315 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0515  ADP-ribose pyrophosphatase  45.1 
 
 		 168 aa  51.6  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01957  GDP-mannose mannosyl hydrolase  28.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.677204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2097  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0651329  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2529  NUDIX hydrolase  34.69 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.412332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3757  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  32.18 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  36.28 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01946  hypothetical protein  28.33 
 
 		 159 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.666581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  34.55 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  36.28 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>