More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A2396 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
141 aa  291  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  99.29 
 
 
141 aa  290  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  99.29 
 
 
141 aa  290  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  99.29 
 
 
141 aa  290  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  99.29 
 
 
141 aa  290  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  99.29 
 
 
141 aa  288  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  87.94 
 
 
141 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  87.23 
 
 
141 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  87.94 
 
 
141 aa  260  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  87.23 
 
 
141 aa  259  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  87.23 
 
 
141 aa  259  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  100 
 
 
120 aa  246  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  99.17 
 
 
120 aa  245  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  75.89 
 
 
141 aa  224  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 
146 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.86 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  33.06 
 
 
135 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  33.88 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  30.47 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.95 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.95 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.45 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  33.06 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  33.06 
 
 
132 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2310  NUDIX hydrolase  32.73 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.288899 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  31.45 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3659  hypothetical protein  32.82 
 
 
316 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817347  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  33.88 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
255 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  32.56 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  30.65 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 
299 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  31.36 
 
 
347 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7624  NUDIX hydrolase  35.2 
 
 
169 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  31.88 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  30.65 
 
 
137 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  30.65 
 
 
138 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  31.45 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  30.16 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0880  NUDIX hydrolase  26.28 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.577802  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  32.54 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  34 
 
 
138 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  33.64 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  30.16 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0741  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 
151 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0431808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1319  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06029  ADP-ribose pyrophosphatase MutT  32.23 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  30.3 
 
 
400 aa  50.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2482  NUDIX hydrolase  29.06 
 
 
138 aa  50.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  34.09 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0110  NUDIX hydrolase  28.99 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 
334 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  30.65 
 
 
269 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  30.58 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  27.86 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.33 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  30.58 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  28 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  28.1 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  49.15 
 
 
570 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  29.2 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  28.36 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  29.31 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  29.71 
 
 
365 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  29.31 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2021  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  29.6 
 
 
166 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  28.89 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  29.66 
 
 
138 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  25.76 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
171 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  28.44 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  24.63 
 
 
163 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  34.51 
 
 
312 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  26.19 
 
 
396 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1486  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
131 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00282357  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  30.77 
 
 
505 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  29.52 
 
 
139 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>