74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0455 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0455  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 171 aa  344  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4630  NUDIX hydrolase  34.42 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0969  NUDIX hydrolase  36.91 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.767014  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05631  hypothetical protein  30.56 
 
 		 150 aa  94.7  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1472  NUDIX hydrolase  27.89 
 
 		 150 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181973  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000271  NUDIX hydrolase domain-containing protein  32.81 
 
 		 152 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0412  NUDIX hydrolase  41.74 
 
 		 174 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0161756  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0166  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  34.13 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.46 
 
 		 365 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  36.88 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  36.88 
 
 		 365 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  29.91 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  29.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  30.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  30.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 141 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  30.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  30.77 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  30.77 
 
 		 141 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8438  NUDIX hydrolase  32.32 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.370098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3194  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00231464  hitchhiker  0.000000000651054 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2065  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  27.86 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  34.95 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  29.06 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0905  NUDIX hydrolase  24.78 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.729176  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  32.52 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 184 aa  44.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 160 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  25.2 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0392  NUDIX family hydrolase  32.18 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000292752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  43.94 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1041  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.317547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  30.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0996  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3582  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26900  ADP-ribose pyrophosphatase  27.78 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0736  NUDIX domain-containing protein  32 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0277965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0749  NUDIX family hydrolase  32 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.159748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.63 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  30.43 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.15 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3123  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0687463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.15 
 
 		 140 aa  42.4  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  28.33 
 
 		 140 aa  42  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  62.86 
 
 		 168 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  35.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  44.9 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  44.9 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  35.71 
 
 		 132 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  29.55 
 
 		 141 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  29.13 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 143 aa  42  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 		 146 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2716  MutT/NUDIX family protein  23.66 
 
 		 137 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  32.11 
 
 		 138 aa  40.8  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  33.73 
 
 		 126 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  41.56 
 
 		 383 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 390 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2976  NUDIX hydrolase  46 
 
 		 162 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0507  dATP pyrophosphohydrolase  30.83 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 150 aa  40.8  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3706  hypothetical protein  29.06 
 
 		 314 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.461385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15360  ADP-ribose pyrophosphatase  36.46 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314217  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2947  dATP pyrophosphohydrolase  32.76 
 
 		 127 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.214504  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  37.14 
 
 		 132 aa  40.8  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1196  mutator MutT protein  37.5 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 145 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.33 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>